تم افتتاح المكتبة مع افتتاح المعهد الوطني للتعليم العالي للعلوم الإسلامية سنة 1987 وكان رصيدها في البداية عبارة عن هبات و تبرعات من المحسنين، بعدها أنشأت لها ميزانية خاصة مكنتها من إثراء عناوينها.

مع تحول المعهد إلى كلية العلوم الاجتماعية و العلوم الإسلامية سنة 2000 اتسع حجم المكتبة بشكل كبير وتنوعت فيها العناوين و في هذه المرحلة تم: تصنيف المكتبة، إنشاء برنامج داخلي لها، فتح قاعات المطالعة الداخلية، الأتمتة ضمن برنامج  سنجاب التابع لـ CERIST

ومع تحول الكلية إلى كلية العلوم الإنسانية و الاجتماعية و العلوم الإسلامية سنة 2010 زودت مكتبة قسم العلوم الإسلامية بثروة علمية محترمة، ومع حلول عام 2016 وفي إطار التقسيمات الجديدة للكليات تحولت الكلية إلى كلية العلوم الإسلامية  بجامعة باتنة 1، خلال هذه المرحلة تم توسيع المكتبة بإنشاء مكتبة فرعية بملحقة مجمع الحاج لخضر التابعة للكلية خاصة بالمطالعة الداخلية.